相比之前改造的1260万套，9月2日，住建部副部长齐骥把待改造的1400万套棚改称为“硬骨头”。
齐骥说，目前尚未改造的棚户区大多位于中西部地区、独立工矿区、资源枯竭型城市和三线企业较集中的城市。
这些地区的棚改往往难度较大。齐骥也认为，啃棚改“硬骨头”最难之处在于资金缺口较大，虽然中央政府不断加大棚户区改造补助力度，但仍只占改造资金的一小部分，仍需多渠道筹集。
官方统计数据，2013年财政部下拨的支持城市棚户区改造的355亿元资金中，东部地区588140万元，占16.6%；中部地区1577609万元，占44.4%；西部地区1384251万元，占39%。该项资金主要用于补助政府主导的城市棚户区改造项目，包括拆迁、安置、建设等开支。
中国社科院城市发展与环境研究中心主任牛凤瑞表示，按照今年304万套安置房建设来计算，355亿意味着平均一套房中央只补贴1万元左右，可谓是杯水车薪。
正因为此，棚户区改造投入资金的大头压在了各级地方政府的身上。或也是看到资金难题，国务院在《国务院关于加快棚户区改造工作的意见》中明确，鼓励民间资本参与改造。
“如果是早期的优质商业地块，民间资本进驻的积极性还很大。”中国社科院城市与竞争力研究中心主任倪鹏飞称，现在优质商业地块的改造已经结束，剩下的棚改地段地处偏远，吸引民间资本进入的难度很大。
就算是参与其中，倪鹏飞认为，可能更多的还是代建的性质，也需确保他的最基本利润，地方政府的资金压力仍很明显。
值得一提的是，中央亦支持地方通过融资平台筹集棚户区改造资金。在倪鹏飞看来，如今地方融资平台的风险已经很大，再补缺棚改资金缺口，风险更会加剧。
国土部法律中心主任孙英辉指出，部分省份已出现收不抵支情况。地方政府大规模集中推出土地和利用土地大量融资，积累财政金融风险。
针对部分地区偿债压力加大，国土部也特别强调，进一步防范土地融资过度带来的土地管理和债务风险。
正因此，在鼓励地方政府通过融资平台筹集棚户区改造资金之外，财政部和国土部亦要求，严格规范融资平台的融资行为，不能将地方政府储备土地作为资产注入融资平台公司，不得承诺将储备土地预期出让收入作为融资平台公司偿债资金来源，切实防范财政风险。
