当前中国存在金融与实体经济相互脱节的问题。这种脱节，一方面表现在最需要资金的中、小、微企业普遍存在融资难和融资贵问题，另一方面，中国的商业银行体系对社会存款的运用存在“抽水机效应”，即县域存款被抽调到大城市，县域存贷比一般较低，本地资金不能投入本地经济发展。
县域金融工程将县域资源有机整合，理清了政府和市场的关系，强调政府在市场经济中可以大有作为：通过政府介入金融市场，降低了市场主体的金融风险，提高了县域经济主体抵御金融风险的能力，激发了金融机构金融创新的活力，在很大程度上缓解了中小微企业融资难、融资贵的问题；同时，实现了资本市场向县域经济的有效渗透，为县域企业开拓了资本市场融资的大门。当前的县域金融工程在理论和实践上还可以更进一步发展。例如，当前县域金融工程注重银行的金融创新，实际上，小微金融机构才是服务小微企业的主体，如何实现小微金融机构的变革与发展也应该成为县域金融工程未来应该研究的新内容之一。
